Prinzipiell hättest das einfach in der Doku lesen können, aber hier die Kurzfassung:
Universelle Windows Plattform sind UWP Apps.
Was ist eine App der universellen Windows-Plattform (UWP)? - UWP applications
Also Apps, die man primär über den Windows Store verteilt und in Windows in eine Sandbox ausgeführt werden.
.NET Desktopentwicklung sind "klassische" Win32 Apps.
Erstellen von Desktop-Apps für Windows-PCs - Windows applications
Klassische Runtime, klassischer Installer.
Was Du davon installieren "sollst" kann Dir keiner sagen, da keiner hier Deine Anforderungen kennt.
Musst schon selbst entscheiden ;-)